La nouvelle technologie israélienne peut donner aux autorités sanitaires du monde entier un avertissement préalable avant que les populations ne soient balayées par des variantes de coronavirus qui sont extra-transmissible ou alors plus susceptibles de violer la protection vaccinale.
Il y a une profonde inquiétude aux États-Unis et ailleurs que la variante britannique, plus accrocheuse que le COVID-19 ordinaire, gagne du terrain de manière significative.
Et en Israël, où cette souche représente déjà 95 % des cas, on s’inquiète de la variante sud-africaine, qui a été diagnostiquée chez plus de 450 personnes et dont on pense qu’elle affaiblit l’efficacité du vaccin. Entre-temps, mardi, le ministère de la Santé a annoncé avoir détecté les trois premiers cas de la variante new-yorkaise, qui craint également d’être moins efficacement stoppée par les vaccins.
Mais les autorités du monde entier ont du mal à se faire une idée de la vitesse à laquelle les variantes se propagent. En effet, ces données reposent normalement sur le séquençage du matériel génétique à partir d’échantillons de test individuels – un processus long et coûteux qui n’est généralement effectué que sur un sous-ensemble d’écouvillons.
Des chercheurs de l’Université Ben Gourion affirment avoir trouvé un moyen d’obtenir facilement et à moindre coût une vue d’ensemble de la propagation des variantes, avec une « mise à niveau » des programmes de surveillance des eaux usées contre les coronavirus que de nombreux pays utilisent déjà. Il s’agit d’un kit de test qui ressemble exactement à ceux actuellement utilisés pour évaluer les niveaux de COVID dans les eaux usées, mais il recherche des variantes.
Les chercheurs soumettent un article sur leur technologie pour examen par les pairs, mais l’ont déjà publié en ligne.
Les scientifiques ont développé leur test pour la variante britannique, puis ont créé une version de la technologie qui fonctionne sur la variante sud-africaine, et sont optimistes quant au fait qu’elle puisse être adaptée à d’autres mutations à mesure qu’elles émergent.
« Cela pourrait changer la donne en alertant les autorités sur la propagation de ces variantes dans la population et en leur permettant de prendre les mesures pertinentes qui peuvent aider face à des souches plus transmissibles », a déclaré le microbiologiste, le professeur Ariel Kushmaro, qui a dirigé le recherche, a déclaré au La Lettre Sépharade.
Étant donné que la variante britannique est estimée être 45% plus transmissible que le coronavirus ordinaire, sa prévalence est un renseignement sanitaire vital pour les autorités, a déclaré Kushmaro. Et compte tenu des inquiétudes quant au fait que les vaccins pourraient s’avérer moins efficaces contre la variante sud-africaine, il est important que les responsables aient la possibilité de réévaluer l’assouplissement des restrictions pour les personnes vaccinées s’il progresse, a-t-il ajouté.
Kushmaro a déclaré que si les autorités voient l’une ou l’autre des souches se propager, elles auront la possibilité de mettre en œuvre des politiques, notamment des verrouillages locaux et des tests de conduite ; réévaluer le fonctionnement des écoles, où elles propagent plus que le COVID normal ; et appelons le public à une distanciation sociale vigilante.
La surveillance des eaux usées fournit actuellement une image régionale des niveaux de coronavirus aux responsables de la santé dans certaines parties des États-Unis, d’Europe, d’Australie et d’Israël, mais elle ne leur dit pas si les variantes sont en augmentation.
L’équipe de Kushmaro a créé de nouvelles amorces et sondes – deux aspects clés des systèmes de test – qui détaillent le niveau des variantes britannique et sud-africaine.
Bien que l’invention implique des ajustements complexes à la conception régulière, les instructions pour produire le nouveau test peuvent être facilement détaillées aux sociétés de génomique du monde entier dans le cadre d’un accord de licence, a déclaré Kushmaro.
La variante britannique s’est rapidement propagée en Israël et représente aujourd’hui presque tous les cas de COVID-19, mais dans d’autres pays, elle se propage plus lentement.
« Il existe de nombreux pays où la variante britannique ne s’est pas encore largement répandue, y compris les États-Unis, mais pour la plupart, ils ne font que surveiller s’il y a ou non un coronavirus et ont une idée de la charge virale », a déclaré Kushmaro. « Ce test peut nous aider à relever le défi majeur des variantes. »
